在企业财务管理中，水利建设基金是一项与公共基础设施建设相关的专项资金。根据国家相关政策，部分企业和项目可能符合减免水利建设基金的条件。对于享受减免的企业而言，正确进行账务处理至关重要，以确保财务数据的真实性和合法性。

首先，在收到相关减免通知后，企业应首先确认减免的具体金额及适用范围。通常情况下，减免金额会明确列示于通知文件中，并需附上相应的证明材料。企业应妥善保存这些文件作为后续账务处理的重要依据。

其次，在会计核算方面，减免的水利建设基金应被视为政府补助的一部分。按照会计准则的要求，企业应在实际收到减免款项时确认为当期收益。具体操作时，可在“其他收益”科目下记录该笔收入，并在财务报表中详细说明其来源和性质。

此外，为了保持账务的透明度，企业还需定期对减免事项进行内部审计。这不仅有助于核实减免金额是否准确无误，还能及时发现并纠正潜在的错误或遗漏。同时，定期的审计报告也能为企业提供宝贵的管理信息，帮助企业更好地规划未来的资金使用。

最后，企业在完成账务处理后，应及时向税务机关备案。这是确保减免政策得以有效执行的关键步骤之一。通过备案，税务机关可以全面了解企业的减免情况，从而避免不必要的争议或处罚。

综上所述，妥善处理水利建设基金的减免事项，不仅关系到企业的财务健康，也体现了对国家政策的尊重和遵守。因此，企业应当高度重视这一过程，确保每一步都合规合法，为企业的长远发展奠定坚实的基础。