在房地产开发与转让过程中，土地增值税是一项重要的税种，涉及企业或个人在转让国有土地使用权、地上建筑物及其附属设施时的增值部分。为了合理计算应纳税额，税务机关设定了多项可扣除项目，以确保税收的公平性与合理性。

土地增值税的扣除项目主要包括以下几个方面：

首先，取得土地使用权所支付的金额是重要的扣除项。这包括通过出让、划拨或其他合法方式获得土地使用权所支付的全部费用，如土地出让金、契税、相关手续费等。这些支出在计算增值额时可以作为成本进行扣除，从而减少应纳税所得额。

其次，房地产开发成本也是关键的扣除内容。这涵盖了在土地上进行基础设施建设、房屋建造以及公共配套设施建设所产生的各项费用。具体包括建筑安装工程费、前期工程费、基础设施费、开发间接费用等。这些费用在项目完工后，可以根据实际发生情况进行分摊和扣除。

此外，与转让房地产相关的税费也是可以扣除的部分。例如，在转让过程中缴纳的营业税、城市维护建设税、教育费附加、印花税等，都可以在计算土地增值税时予以扣除。但需注意的是，某些税费可能因政策调整而有所变化，因此需要根据最新规定进行确认。

还有，与转让房地产直接相关的其他合理费用也属于可扣除项目。例如，销售费用、管理费用和财务费用中与转让活动直接相关的部分，可以在一定范围内进行扣除。这部分费用的扣除需要提供充分的凭证和依据，以确保其真实性和合理性。

最后，对于一些特殊情形，如旧房及建筑物的评估价值，也可以按照相关规定进行扣除。这种情况下，通常需要由专业评估机构对房产进行估价，并出具相应的评估报告，作为税务处理的依据。

综上所述，土地增值税的扣除项涵盖了从土地取得、开发到转让过程中的多个环节，旨在合理反映开发成本和实际收益，避免重复征税。企业在进行土地增值税申报时，应严格按照税法规定，准确归集和核算各项扣除项目，确保税务合规性。同时，建议企业在日常经营中注重资料的完整性和规范性，以便在需要时能够及时提供相关证明材料，降低税务风险。